该地区的地势为北高南低，河谷向南敞开，气流可溯谷而上，受季风影响大，干湿季节分明。且山体高峻，又形成迥然不同的垂直气候带。4000米雪线以上的白雪群峰峭拔，云蒸霞蔚。由于垂直气候明显，梅里的气候变幻无常，雪雨阴晴全在瞬息之间。雨季一般在7-8月间，一月，白天7-12度，晚上零下2-5度。11月-3月，天气非常晴朗。冬天会有几天下雪，可能导致车辆无法通行。
而雪线以下，冰川两侧的山坡上覆盖着茂密的高山灌木和针叶林，郁郁葱葱，与白雪相映出鲜明的色彩。林问分布有肥沃的天然草场，竹鸡、漳子、小熊猫、马鹿和熊等动物活跃其间。
高山草甸上还盛产虫草、贝母等珍贵药材。梅里雪山，不仅地形复杂，气候变化更为复杂，每年夏季，山脚河谷气温可达11-29℃，高山则为-10℃-20℃。年降水量平均为600mm，大都集中在6—8月，此期间气候极不稳定，是登山的气候禁区。
